TÜRKÇE
ENGLISH
Genel Bilgi
| Birim | FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ |
| ELEKTRİK-ELEKTRONİK MÜHENDİSLİĞİ (DR) (İNGİLİZCE) | |
| Kod | EE712 |
| Ad | Advanced Topics in Bioinformatics |
| Dönem | 2018-2019 Eğitim-Öğretim Yılı |
| Dönem | Bahar |
| Süre (T+U) | 3-0 (T-U) (17 Hafta) |
| AKTS | 6 AKTS |
| Yerel Kredi | 3 Yerel Kredi |
| Eğitim Dil | İngilizce |
| Seviye | Belirsiz |
| Tür | Normal |
| Öğretim Şekli | Yüz Yüze Öğretim |
| Bilgi Paketi Koordinatörü | Doç. Dr. TURGAY İBRİKÇİ |
| Dersin Öğretim Elemanı |
Güncel dönem ders programı henüz yapılmamıştır.
|
Dersin Amacı / Hedefi
Bu ders biyoinformatikte son zamanlarda ortaya çıkan biyolojik soruları ele almak için bilgisayarların, yazılım araçlarının ve veri tabanlarının entegrasyonunu içermektedir. Biyoinformatik yaklaşımlar genellikle büyük veri setleri üreten ana girişimler için kullanılır.
Dersin İçeriği
Bu ders, biyoinformatik problemlerini tarih bağlamında tanıtmayı kapsar. Biyolojideki biyoinformatiğe yol açan gelişmeler, Dizi karşılaştırması, Genom dizilimi, Proteomik
Dersin Ön Koşulu
Kaynaklar
Notlar
Dersin Öğrenme Çıktıları
| Sıra | Dersin Öğrenme Çıktıları |
|---|---|
| ÖÇ01 | Bu dersin öğretilmesi, öğrencilerin biyoinformatik hakkındaki son soruları çalışma pratikleri ile çözmeleri için arka plan toplamasını sağlayabilir. |
| ÖÇ02 | Biyolojik problemlere mühendislik yaklaşımı |
| ÖÇ03 | Öğrencilerin biyoinformatik, proteomik, genomik ve sistem biyolojisi alanındaki belirli konulardaki literatürün gözden geçirilmesini içeren bir kütüphane araştırma projesi yürütmeleri beklenmektedir. |
| ÖÇ04 | Seminer verebilme |
| ÖÇ05 | Makale yazabilme |
Program Öğrenme Çıktıları ile İlişkisi
| Sıra | Tür | Program Öğrenme Çıktıları | Duzey |
|---|---|---|---|
| PÖÇ01 | - | Elektrik-Elektronik Mühendisliğinin temellerini oluşturan dalların en az birinde, bilgi düzeyini yüksek lisans düzeyinin ötesine çıkararak uzmanlaşabilme | |
| PÖÇ02 | - | Uzmanlaştığı alanın içerdiği tüm konuların birlikte oluşturduğu bütünlüğü kavrayabilme | |
| PÖÇ03 | - | Uzmanlaştığı alandaki mevcut bilimsel literatüre hakim olabilme, literatürü kritik şekilde analiz edebilme | |
| PÖÇ04 | - | Alanının, ilişkili olduğu diğer dallarla olan disiplinlerarası etkileşimini kavrayabilme, benzer etkileşimler önerebilme | |
| PÖÇ05 | - | Kuramsal veya deneysel çalışma yapma becerisine sahip olabilme | |
| PÖÇ06 | - | Araştırma sonucunda edinilen bilgileri derleyerek bütünlüklü bir bilimsel metin oluşturabilme. | |
| PÖÇ07 | - | Tez konusu üzerinde, danışmanının belirlediği çerçeve içinde, konunun gerektirdiği mantıksal bütünlüğe uygun olarak, programlı bir şekilde çalışabilme. | |
| PÖÇ08 | - | Bilimsel veri tabanlarında literatür araştırması yapabilme; özelde, veri tabanlarını uygun ve doğru şekilde tarama ve listelenen unsurları değerlendirme, kategorize edebilme | |
| PÖÇ09 | - | Uzmanlık alanında İngilizce olarak yazılmış bir bilimsel metni rahatlıkla okuyup anlayacak ve benzer bir metni yazabilecek düzeyde İngilizce'ye ve ilgili İngilizce jargona hakim olma | |
| PÖÇ10 | - | Bildiği bir programlama dilinde genelde belirli bir amaca yönelik, özelde uzmanlık alanı ile ilgili olan bir bilgisayar programı yazabilme. | |
| PÖÇ11 | - | Uzmanlık alanıyla veya yakın alanlarla ilgili ders planlayabilme ve ders verebilme. | |
| PÖÇ12 | - | Alanı ile ilgili sorunların çözümlenmesini gerektiren ortamlarda yol gösterici olabilme, insiyatif alabilme | |
| PÖÇ13 | - | Uygun bir dil ve tarz ile insanlarla iletişim kurabilme | |
| PÖÇ14 | - | Akademisyenliğin, gerek eğitim-öğretim gerekse araştırma yönlerinin gerektirdiği etik değerleri benimseme | |
| PÖÇ15 | - | Uzmanlık alanı ile ilgili konularda proje, politika, süreç üretebilme ve bu öğeleri değerlendirebilme | |
| PÖÇ16 | - | Mevcut araştırma deneyimine dayanarak yeni konularda da araştırma yapabilme |
Haftalık Akış
| Hafta | Konu | Ön Hazırlık | Yöntemler |
|---|---|---|---|
| 1 | Giriş biyolojisi, biyolojik verilerin temel özellikleri | Internet kaynakları | |
| 2 | Genom Analiz Teknikleri - I | Internet kaynakları | |
| 3 | Genom Analiz Teknikleri - II | Internet kaynakları | |
| 4 | Karşılaştırmalı Genom Analizi | Internet kaynakları | |
| 5 | Protein Yapısı ve İşleviyle İlgili Açık Problemler-I | Internet kaynakları | |
| 6 | Protein Yapısı ve İşleviyle İlgili Açık Problemler-II | Internet kaynakları | |
| 7 | Gen Düzenleme ve Transkriptomik | Internet kaynakları | |
| 8 | Ara Sınav | Bu haftaya kadar olan konuları kapsar. | |
| 9 | Makina Öğrenmesi -I | Internet kaynakları | |
| 10 | Makina Öğrenmesi-II ile derin öğrenme | Internet kaynakları | |
| 11 | Bilgisayar Bilimlerinde Büyük veri algoritmaları | Internet kaynakları | |
| 12 | Biyoinformatikte Veri / Metin Madenciliği | Internet kaynakları | |
| 13 | Sunumlar - I | Sunum | |
| 14 | Sunumlar - II | Sunum | |
| 15 | Sunumlar - III | Sunum | |
| 16 | Yarıyıl Sonu Sınavları | Bütün konuları kapsar | |
| 17 | Yarıyıl Sonu Sınavları | Bütün konuları kapsar |