BİS614 İleri Medikal İnformatik

6 AKTS - 2-2 Süre (T+U)- . Yarıyıl- 3 Yerel Kredi

Genel Bilgi

Kod BİS614
Ad İleri Medikal İnformatik
Dönem 2022-2023 Eğitim-Öğretim Yılı
Yarıyıl . Yarıyıl
Süre (T+U) 2-2 (T-U) (17 Hafta)
AKTS 6 AKTS
Yerel Kredi 3 Yerel Kredi
Eğitim Dil Türkçe
Seviye Doktora Dersi
Tür Normal
Öğretim Şekli Yüz Yüze Öğretim
Bilgi Paketi Koordinatörü Dr. Öğr. Üyesi Yusuf Kemal ARSLAN


Dersin Amacı / Hedefi

Öğrencilere DNA ve protein dizi hizalaması, protein yapısal hizalaması, protein/RNA yapısı tahmini, filogenetik ağaç yapımı, mikrodizi veri analizi gibi biyoinformatiğin temel sorunlarına yaklaşım ile ilgili kazanım sağlamak

Dersin İçeriği

Genom dizileme, mikrodizi teknolojisi ve diğer yüksek verimli deneysel yöntemler gibi biyolojik deneyler tarafından üretilen büyük miktarda bilginin madenciliği için hesaplama teknikleri tanıtılacaktır.

Dersin Ön Koşulu

Temel genetik ve istatistik bilgisi

Kaynaklar

Shortliffe, E. H., Perreault, L. E., Wiederhold, G., & Fagan, L. M. (Eds.). (1990). Medical informatics: computer applications in health care. Addison-Wesley Longman Publishing Co., Inc..

Notlar

Shortliffe, E. H., Perreault, L. E., Wiederhold, G., & Fagan, L. M. (Eds.). (1990). Medical informatics: computer applications in health care. Addison-Wesley Longman Publishing Co., Inc..


Dersin Öğrenme Çıktıları

Sıra Dersin Öğrenme Çıktıları
ÖÇ01 Tanımlayıcı yöntemlerle verileri özetler.
ÖÇ02 Olasılık ilkeleri ve olasılık dağılımları kavramı hakkında iyi bir kavrayışa sahip olur.
ÖÇ03 Öğrenciler istatistiksel örnekleme ve tahmin hakkında bilgi sahibi olur
ÖÇ04 Güven aralıkları ve hipotez testleri hakkında çalışma bilgisi kazanır.
ÖÇ05 Olasılık dağılımlarını kullanarak biyolojik deneysel verileri modeller
ÖÇ06 Büyük miktarlarda ve çok boyutlu biyolojik verileri kümeler, görselleştirir ve özetler


Program Öğrenme Çıktıları ile İlişkisi

Sıra Tür Program Öğrenme Çıktıları Duzey
PÖÇ01 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Biyoistatistik yüksek lisans programında kazandığı yeterliliklerine dayalı olarak alanındaki güncel ve ileri düzeydeki bilgileri (Meta analizi, veri madenciliği, çok değişkenli ve boylamsal veri analizi, sağkalım analizi, regresyon vs.) alana yenilik getirecek özgün tanımları, kavramları ve teoremleri kavrar. 2
PÖÇ02 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Uzmanlık gerektiren bilgileri kullanarak, kendi alanı ve ilişkili olduğu alanlardaki yeni ve karmaşık fikirleri analiz eder, sentezler ve yorumlar. 3
PÖÇ03 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Biyoistatistik alanında sıklıkla kullanılan teknolojik araç ve yazılımlar hakkında ileri düzeyde bilgi sahibidir.
PÖÇ04 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Etik ilkelerin ve etik kurulların birey ve toplum için önemini bilir. Etik kurullarda Biyoistatistikçinin önemini kavrar.
PÖÇ05 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Sağlık alanına yönelik yapılan çalışmalarda sürekli olarak kullanılan istatistiksel yöntemler hakkında ileri düzeyde bilgi sahibidir.
PÖÇ06 Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı Biyoistatistik alanındaki bilgileri sistematik bir yaklaşımla değerlendirir 2
PÖÇ07 Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı Biyoistatistik alanına yenilik getiren, yeni bir düşünce, yöntem, tasarım veya uygulama geliştirir, bilinen bir düşünce, yöntem, tasarım veya uygulamayı geliştirir ve farklı bir alana uygular. 4
PÖÇ08 Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı Tıp ve sağlık bilimlerinde ortaya çıkan yeni ve karmaşık problemler için gözlemsel ve kliniksel araştırma tasarımı kurgular, eleştirel analizi yapar, yorumlar ve raporlar.
PÖÇ09 Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı Sağlık bilimlerinde tanı ve tedavide karar verme sürecindeki ileri istatistiksel yöntemleri kullanır, bu alanda çalışan araştırıcılara danışmanlık yapar.
PÖÇ10 Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı Biyoistatistik alanı ile ilgili çalışmalarda üst düzey beceri gerektiren araştırma ve analiz yöntemlerini kullanır. 3
PÖÇ11 Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı Sağlık bilimlerinde sıkça kullanılan teknik ve yöntemleri gibi ileri istatistik yöntemlerini özgün düşünce, araştırma ile uzmanlık düzeyinde geliştirir ve uygular.
PÖÇ12 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Biyoistatistik alanına yenilik getiren özgün bir çalışmayı bağımsız olarak gerçekleştirir
PÖÇ13 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Bilimsel bir makaleyi değerlendirebilecek ileri düzeyde istatistiksel analiz yapar.
PÖÇ14 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Biyoistatistik alanı ile ilgili makale okuma, yazma becerisi geliştirir ve ulusal ve/veya uluslararası hakemli dergilere makale başvurusu yapar
PÖÇ15 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Özgün ve disiplinlerarası sorunların çözümlenmesinde etkin rol alır
PÖÇ16 Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği Yaratıcı ve eleştirel düşünme, sorun çözme ve karar verme gibi üst düzey zihinsel süreçleri kullanarak Biyoistatistik alanı ile ilgili yeni düşünce ve yöntemler geliştirir.
PÖÇ17 Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği Kanıta ulaşmanın yollarını kavrar ve elde ettiği kanıtlara eleştirel değer biçer.
PÖÇ18 Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği Yaşam boyu öğrenme ve mesleki gelişim ilkelerini bir tutum olarak belirler ve bu tutumunu çalışmalarında sergiler.
PÖÇ19 Yetkinlikler - İletişim ve Sosyal Yetkinlik Sağlık mesleğinin gerektiği sosyal ilişkilerin dinamiklerini kavrar ve bu ilişkileri yönlendiren normları eleştirel bir bakış açısıyla değerlendirir ve geliştirir
PÖÇ20 Yetkinlikler - İletişim ve Sosyal Yetkinlik Disiplinlerarası çalışmalarda diğer uzman kişilerle alandaki konuları etkin iletişim becerilerini kullanarak tartışır, özgün görüşlerini savunarak akademik danışmanlık yapar 2
PÖÇ21 Yetkinlikler - İletişim ve Sosyal Yetkinlik Uluslararası bilimsel ortamlarda yabancı dil bilgisi ile yazılı, sözlü ve görsel iletişim kurar
PÖÇ22 Yetkinlikler - Alana Özgü Yetkinlik Biyoistatistik ve tıbbi bilişim bilgisini kullanarak yaşadığı topluma bilgi ve becerilerini sunarak toplumun bilgi toplumu olmasına katkıda bulunur
PÖÇ23 Yetkinlikler - Alana Özgü Yetkinlik Biyoistatistik ile ilgili karşılaşılan sorunların çözümünde özgün görüşlerini savunarak işlevsel etkileşim kurar
PÖÇ24 Yetkinlikler - Alana Özgü Yetkinlik Etkili iletişim becerilerini kullanarak danışmanlık verebilir, araştırmalarda ekip çalışması içinde yer alır, bilimsel etik kuralları savunur
PÖÇ25 Yetkinlikler - Alana Özgü Yetkinlik Alanın gereği olarak diğer sağlık disiplinleri ile çalışabilme deneyimine sahiptir. 4
PÖÇ26 Yetkinlikler - Alana Özgü Yetkinlik Sağlık alanına yönelik yaptığı çalışmalarda doğru istatistiksel yöntemleri seçer ve uygular, doğru yorumlar. İleri düzeyde analiz ve sentez yapar.
PÖÇ27 Yetkinlikler - Alana Özgü Yetkinlik Sağlık alanı ile ilgili güncel gelişmeleri ve bilgileri ülke gerçekleri doğrultusunda toplum yararına kullanır.


Haftalık Akış

Hafta Konu Ön Hazırlık Yöntemler
1 Medikal enformatiğe giriş Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
2 Medikal enformatik Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
3 Genetik bilgi Okuma, Literatür tarama Öğretim Yöntemleri:
Anlatım, Bireysel Çalışma
4 Genetik bilgi 2 Okuma, Literatür tarama Öğretim Yöntemleri:
Anlatım, Bireysel Çalışma
5 DNA ve protein dizi hizalaması Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
6 Protein yapısal hizalaması Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
7 protein/RNA yapısı tahmini Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
8 Ara Sınavlar Ölçme Yöntemleri:
Yazılı Sınav
9 Filogenetik ağaç yapımı Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
10 mikrodizi veri analizi Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
11 Çoklu regresyon ve temel bileşenler analizi Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım, Soru-Cevap
12 Çoklu regresyon ve temel bileşenler analizi 2 Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım, Alıştırma ve Uygulama, Tartışma
13 Monte-Carlo-Markov zinciri, Metropolis-Hastings algoritması ve Gibbs örneklemesi Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım, Gösterip Yaptırma
14 Çekirdek (Kernel) yöntemler Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
15 Destek vektör makinaları Okuma Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
16 Yarıyıl Sonu Sınavları Ölçme Yöntemleri:
Yazılı Sınav
17 Yarıyıl Sonu Sınavları Ölçme Yöntemleri:
Ödev


Öğrenci İş Yükü - AKTS

Çalışmalar Sayısı Süresi (Saat) İş Yükü (Saat)
Ders ile İlgili Çalışmalar
Ders (Sınav haftaları dahil değildir) 14 4 56
Sınıf Dışı Ders Çalışma (Ön çalışma, pekiştirme) 14 4 56
Değerlendirmeler ile İlgili Çalışmalar
Ödev, Proje, Diğer 1 2 2
Ara Sınavlar (Yazılı, Sözlü, vs.) 1 12 12
Yarıyıl/Yıl Sonu/Final Sınavı 1 28 28
Toplam İş Yükü (Saat) 154
Toplam İş Yükü / 25 (s) 6,16
AKTS 6 AKTS

Güncelleme Zamanı: 17.11.2022 03:11